正面评价
李登辉在任期中，积极推动蒋经国晚年未竟的民主化改革，撤销了”万年国代“，彻底终止了蒋家一家在台澎金马的统治历史，并顺利完成了直接”民选“领导人及政党轮替，为台湾地区民主政治变革做出了突出贡献。其任内施行”在地化“，一定程度上促进了政权的平稳运作。 2007年台湾《联合报》所作的对历任“总统”评价的民调，11%的民众肯定李登辉对台湾贡献最大，仅次于蒋经国（约50%），高于蒋介石（6%）和陈水扁（5%）。
负面评价
李登辉出生于日本殖民地（台湾），自幼受过日本军国主义教育，其兄死于日本与东南亚国家的战争中，使其萌生强烈的”亲日“色彩，一定程度上阻碍其评价日本、中国大陆和台湾关系的公正性与合理性，也直接损害了海峡两岸中国人的民族自尊心，不利于两岸关系和平发展。 李登辉在其任内多次搞”台湾独立“，使其自身的形象在中国大陆民众中陷于低谷，并以负面政治人物的形象而为中国人所熟知 。 李登辉在任期内搞黑钱政治，损害了得来不易的台湾”民主“成果，也使其政客的本质暴露无遗，并曾被李敖多次在立法机构起诉，其本人涉嫌经济贪腐问题更为人所不齿。 蒋经国临终感叹选择李登辉是人生败笔，在病逝之前，曾对身边家人哀叹说：“我看错了人！”。
